MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 plasmid pFN3

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009506	TGA	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009506	TTA	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009506	TAT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009506	A	6	6	51	56	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009506	T	8	8	80	87	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009506	TA	3	6	99	104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009506	ATAAA	2	10	146	155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009506	AGTA	2	8	171	178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009506	T	7	7	202	208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009506	T	6	6	252	257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009506	ATATA	2	10	269	278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009506	CTT	2	6	294	299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009506	CTA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009506	GAA	2	6	319	324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009506	T	8	8	334	341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009506	ATA	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009506	TAT	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009506	TTA	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009506	CAG	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009506	T	6	6	430	435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009506	TAAT	2	8	447	454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009506	A	6	6	466	471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009506	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009506	T	7	7	510	516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009506	ATT	2	6	524	529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009506	TAA	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009506	TA	3	6	573	578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009506	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009506	TA	3	6	645	650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009506	TATT	2	8	670	677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009506	TTA	3	9	678	686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009506	AATA	2	8	709	716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009506	AAT	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009506	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009506	ACC	2	6	763	768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009506	T	7	7	839	845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009506	T	7	7	848	854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009506	T	6	6	860	865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009506	ACT	3	9	887	895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009506	GTA	5	15	905	919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009506	ATTT	2	8	924	931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009506	TAT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009506	ATA	2	6	948	953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009506	TA	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009506	A	6	6	973	978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009506	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009506	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009506	T	6	6	1049	1054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009506	ATA	2	6	1060	1065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009506	T	6	6	1081	1086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009506	A	7	7	1087	1093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009506	TAG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009506	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009506	T	8	8	1136	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009506	ATA	2	6	1146	1151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009506	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009506	TAT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009506	AAAT	2	8	1198	1205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009506	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009506	ATA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009506	AT	3	6	1256	1261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009506	A	6	6	1262	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009506	TAT	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009506	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009506	A	6	6	1295	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009506	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
67	NC_009506	A	6	6	1321	1326	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
68	NC_009506	GAT	3	9	1327	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
69	NC_009506	TTA	2	6	1358	1363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
70	NC_009506	TAC	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557804
71	NC_009506	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
72	NC_009506	ATA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
73	NC_009506	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
74	NC_009506	AGA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
75	NC_009506	A	7	7	1512	1518	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
76	NC_009506	T	6	6	1542	1547	0 %	100 %	0 %	0 %	148557804
77	NC_009506	TAAAA	2	10	1554	1563	80 %	20 %	0 %	0 %	148557804
78	NC_009506	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557804
79	NC_009506	AT	3	6	1692	1697	50 %	50 %	0 %	0 %	148557804
80	NC_009506	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
81	NC_009506	AATG	2	8	1764	1771	50 %	25 %	25 %	0 %	148557804
82	NC_009506	TAAA	2	8	1796	1803	75 %	25 %	0 %	0 %	148557804
83	NC_009506	AGA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
84	NC_009506	AGT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
85	NC_009506	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
86	NC_009506	TAA	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
87	NC_009506	A	6	6	1996	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
88	NC_009506	AGA	3	9	2013	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
89	NC_009506	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
90	NC_009506	GAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
91	NC_009506	A	7	7	2106	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
92	NC_009506	A	7	7	2156	2162	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
93	NC_009506	GAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
94	NC_009506	GAT	3	9	2242	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
95	NC_009506	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
96	NC_009506	AGA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
97	NC_009506	AACTT	2	10	2303	2312	40 %	40 %	0 %	20 %	148557804
98	NC_009506	AGA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
99	NC_009506	AG	3	6	2330	2335	50 %	0 %	50 %	0 %	148557804
100	NC_009506	A	7	7	2336	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
101	NC_009506	A	6	6	2368	2373	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
102	NC_009506	TTC	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
103	NC_009506	GAA	3	9	2434	2442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
104	NC_009506	A	8	8	2441	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
105	NC_009506	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
106	NC_009506	GAAAA	2	10	2461	2470	80 %	0 %	20 %	0 %	148557804
107	NC_009506	AGAA	2	8	2499	2506	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
108	NC_009506	A	8	8	2520	2527	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
109	NC_009506	A	6	6	2534	2539	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
110	NC_009506	A	6	6	2554	2559	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
111	NC_009506	AAGA	2	8	2574	2581	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
112	NC_009506	T	7	7	2586	2592	0 %	100 %	0 %	0 %	148557804
113	NC_009506	A	7	7	2661	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
114	NC_009506	AAG	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
115	NC_009506	AGAA	2	8	2706	2713	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
116	NC_009506	TATT	2	8	2714	2721	25 %	75 %	0 %	0 %	148557804
117	NC_009506	AAAAGA	2	12	2727	2738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148557804
118	NC_009506	AGA	3	9	2736	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
119	NC_009506	AGTTGC	2	12	2763	2774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148557804
120	NC_009506	GTT	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557804
121	NC_009506	A	7	7	2786	2792	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
122	NC_009506	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
123	NC_009506	AAAG	2	8	2820	2827	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
124	NC_009506	CTT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
125	NC_009506	AC	3	6	2873	2878	50 %	0 %	0 %	50 %	148557804
126	NC_009506	AGA	2	6	2886	2891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
127	NC_009506	AAGAA	2	10	2892	2901	80 %	0 %	20 %	0 %	148557804
128	NC_009506	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
129	NC_009506	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
130	NC_009506	CGA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148557804
131	NC_009506	A	6	6	2992	2997	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
132	NC_009506	A	7	7	3005	3011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009506	TA	3	6	3016	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009506	ATA	3	9	3019	3027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009506	T	8	8	3073	3080	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
136	NC_009506	TAT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
137	NC_009506	TGT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557805
138	NC_009506	T	8	8	3119	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
139	NC_009506	T	8	8	3131	3138	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
140	NC_009506	T	6	6	3174	3179	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
141	NC_009506	TTC	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
142	NC_009506	ATTTT	2	10	3204	3213	20 %	80 %	0 %	0 %	148557805
143	NC_009506	T	7	7	3210	3216	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
144	NC_009506	T	7	7	3266	3272	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
145	NC_009506	TAT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
146	NC_009506	T	7	7	3298	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
147	NC_009506	TATAT	2	10	3319	3328	40 %	60 %	0 %	0 %	148557805
148	NC_009506	ATT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.